Geenitekniikka on
biologian tutkimusala joka tutkii perintöaineksen eristämistä, analysointia,
muokkaamista ja siirtämistä muihin eliöihin tai soluihin. Geenitekniikassa on
kehitelty erilaisia tutkimusmenetelmiä joiden avulla saadaan erilaisiin
tarkoituksiin sopivaa tietoa.
DNA:n emäsjärjestyksen
selvittämiseen käytettävä menetelmä on nimeltään sekvensointi. DNA:n
emäsjärjestystä tarvitaan esim. jos halutaan selvittää missä osassa perimää
tietty geeni sijaitsee, missä tilanteissa ja miten se ilmenee, onko saman lajin
eri yksilöiden geeneissä eroja tai miten geeni on muuntunut lähisukuisilla
lajeilla.
DNA:n emäsjärjestyksen
selvittäminen on nopeasti kehittyvä ja melko arkipäiväinen toimitus nykyaikana.
Sekvensointiin käytetään automaattisia sekvensointilaitteita. Laitteet pystyvät
rinnakkaissekvensointitekniikan vuoksi lukemaan muutamassa tunnissa satojen
miljoonien emäsparien järjestyksen.
Sekvensoinnilla saatavaa
genomitietoa tarvitaan geenien toiminnan analysoimiseen, geenivirheiden
etsimiseen, geenien muokkaamiseen ja geenisiirtoihin
Sekvensoinnin vaiheet
Sekvensoinnissa käytetään
kahta geenitekniikan menetelmää: PCR ja elektroforeesi.
DNA-juoste saadaan
hajoamaan yksijuosteiseksi kuumentamalla. Samaan koeputkeen laitetaan myös
alukkeita, DNA-polymeraasia, kaikkia neljää DNA-nukleotidityyppiä (A, T, C,G)
ja lopettavia nukleotideja.
Ensimmäinen vaihe on PCR-vaihe.
Tässä vaiheessa DNA-polymeraasi jonka tehtävä on tavallisessakin solussa ohjata
DNA:n rakentumista alkaa nyt koota vapaana olevista nukleotideista uutta
juostetta. Kun paikalle osuu lopettava nukleotidi, synteesi loppuu.
PCR-vaiheesta saadaan lukuisia eripituisia DNA-pätkiä jotka voidaan tunnistaa
lopettavien nukleotidien merkkiaineista.
Seuraavassa
elektroforeesi-vaiheessa pätkät laitetaan geeliin, jossa lyhyemmät pätkät kulkevat
pidemmän etäisyyden kuin pitkät niin että yhdenkin nukleotidin ero saadaan
näkyviin.
Tulostin havaitsee eri
merkkiaineilla merkityt lopettavat nukleotidit ja piirtää kuvion jossa eri
emäkset näkyvät erivärisinä.
Milla-Maria
Ei kommentteja:
Lähetä kommentti